stas27>>Для нас одной из главных проблем оказалось то, что (1) ДНК не хочет прилипать к графитовым подложкам для этой микроскопии и (2) её невозможно расправить надёжно. Она же длинная, поэтому в растворе скручивается в клубок. Провозились сколько-то и плюнули.
yuu2>А нейтронографией пробовали? А то в Дубне вот ею достаточно детально "срисовывали" вирус спида - не распрямляя его на подложке.
Я не знаю, что именно делали с вирусом в Дубне. Дело в том, что есть разные классы задач. Для вируса, может быть, хотели посмотреть общее устройство вирусной частицы, без детализации до уровня отдельных аминокислот/оснований. Для этого нужен другой класс разрешения, и там совершенно другие требования к матанализу полученных результатов. Кстати, интересно, Вы не знаете, какое разрешение у этой самой нейтронографии? Из этого можно было бы оценить...
В любом случае, даже если они смотрели с разрешением, достаточным для чтения последовательности нуклеиновых кислот, в вирусе СПИДа геном в ~10000 пар оснований (п.о.), гаплоидный геном человека - 3 миллиарда пар. Понятно, их не определяют за раз, сейчас популярно чтение кусками по где-то 150 тыс. п.о. (связано с технологией). Сложности разрешения таких структур растут далеко не линейно, а гораздо быстрее. Если брать куски меньше - возникает куча проблем, главные - резкое увеличение количества фрагментов, которые надо читать и сложности различения повторов, которыми нафарширован наш геном (около 5% находятся в повторах длиной до 600 тыс. п.о., которые на 97-99% одинаковы). Их и так-то сейчас читать очень сложно.
В общем, если кто-нибудь придумает, как снизить цену секвенирования с ~100 мегабаков за геном (и то не идеально вычитанный, а черновой) до хотя бы сотен тысяч доларей может расчитывать на вечную признательность человечества (и кучу мат. благ, пока технологию не упрут
).